免费论文查重入口的兼容性问题主要包括浏览器兼容性、操作系统兼容性和文件格式兼容性。首先，不同的免费论文查重入口可能对不同浏览器的支持程度不同，有些可能在某些浏览器上无法正常运行。其次，操作系统也是一个影响因素，有些免费查重入口可能只支持特定操作系统，导致部分用户无法使用。另外，文件格式兼容性也是一个常见问题，有些入口可能只支持特定格式的文档，对于其他格式则无法进行查重。因此，在选择使用免费论文查重入口时，用户需要留意这些兼容性问题，以确保能够顺利使用服务。

免费论文查重入口的兼容性问题还包括网络环境兼容性和插件依赖兼容性。在网络环境不稳定或受限的情况下，部分免费查重入口可能无法正常工作，导致用户体验下降甚至无法使用。此外，有些免费查重入口可能依赖于特定的插件或软件，如果用户设备未安装相关插件或软件，可能会导致无法正常使用免费查重服务。因此，用户在选择免费论文查重入口时，需要考虑到网络环境和插件依赖等兼容性问题，以确保顺利使用服务。